Иконостас церкви в Дармштадте выполнен в соответствии с церковными канонами. Правда, здесь нет иконы святого покровителя храма с правой стороны и иконы Предтечи с левой, так как пространство маленькой церкви слишком узко, чтобы расположить весь иконостас по ее ширине. Поэтому икона, изображающая святую покровительницу храма — Святую Равноапостольную Марию Магдалину — находится на стене над входом в церковь.
С правой стороны перед иконостасом на аналое выложена для поклонения верующих икона святых угодников. На втором аналое, слева перед иконостасом, находится икона Божьей Матери Казанская.
Выполненный из тёмного дуба, искусно вырезанный иконостас, был расписан известным русским иконописцем Карлом Т. Неффом. Нефф писал в западно-итальянском («назарейском») стиле. В России Нефф и его ученики, среди прочих церквей, расписывали Храм Христа Спасителя (это был самый большой храм в Москве, взорванный по приказу Сталина в 1932 году; восстановление этого храма началось в 1995 году) и огромный Исаакиевский собор в Санкт-Петербурге (он использовался коммунистами в качестве музея атеизма). В Германии, куда Нефф несколько раз приезжал на лечение в летние месяцы, он расписал иконостасы русской церкви в Бад-Эмс, Висбадене и Шлос-фон-Ремплин (Замке Ремплин). Эти иконостасы с 1935 года находятся в русской церкви Воскресения Христова в Брюсселе. Написанные Неффом иконы не соответствуют русской иконографии с её строгим византийским образцом, но следуют вкусу 19-го столетия. Они написаны в стиле, который встречается во многих русских церквях, построенных в Западной Европе в 19-м веке. Правда, для русской иконописи этот стиль нетипичен, однако он является явным свидетельством западного русского церковного искусства 19-го столетия. Несомненно, Нефф является самым ярким представителем этой церковной живописи. После того, как захватившие власть в России коммунисты разрушили большую часть церквей 19-го века, данный стиль живописи и иконостасы упомянутых церквей в Германии стали редким, а потому ценным с точки зрения искусства, памятником этой эпохи русской церковной живописи, просуществовавшей лишь около полувека.
Эскизы для мозаики апсиды и наружных стен, а также богатые орнаменты на стенах и сводах, равно как и две хоругви с вышивкой находившиеся до 1988 г. возле иконостаса были изготовлены Виктором Васнецовым (1848-1926). Его роль в русской церковной живописи состоит, прежде всего, в том, что он отказался от упомянутого выше стиля живописи и снова обратился к старорусской иконописи с её строгими формами. Знаменитой работой художника является роспись монументального Собора Святого Князя Владимира в Киеве. Мозаичные картины по эскизам Васнецова были воплощены художником Фроловым в Санкт-Петербурге и привезены в церковь в Дармштадте. Орнаменты были выполнены петербургскими художниками — профессором Перминовым и Кузиком.
Мозаика в апсиде алтаря представляет Богоматерь, восседающую с младенцем Христом на Небесном престоле в окружении ангелов. В алтарном своде находится текст хвалебной песни из Евангелия от Луки (1 :46): «Величит душа Моя Господа, и возрадовася дух Мой о Бозе, Спасе Моем».
На обратной стороне хоругвей с вышивкой с образами Господа и Пресвятой Богородицы — изображения святых покровителей царской четы: Николая Чудотворца (на хоругви с ликом Христа) и Святой Мученицы Александры (на хоругви с образом Богородицы). Икона Казанской Божьей Матери, выложенная для почитания верующими на левом аналое, первоначально принадлежала Великой Княгине Елизавете, старшей сестре Царицы. Великая Княгиня Елизавета подарила эту икону одному русскому монаху, Отцу Серафиму. Отец Серафим распорядился в 1918 году, чтобы прах Великой Княгини и убиенной вместе с ней монахини Варвары был перевезен из Сибири через Китай в Святую Землю, где обе мученицы нашли свое последнее пристанище в склепе русской церкви в Гефсимании. После канонизации новомучениц их мощи поместили для почитания перед иконостасом. Незадолго перед смертью отец Серафим подарил икону шведской Королеве Луизе, урожденной фон Баттенберг, которая завещала ее церкви в Дармштадте, где в 1903 году венчались ее родители.
В правом приделе храма находится ковчежец с плащаницей, на которой изображен лежащий во гробе Христос. По краю написано: «Благообразный Иосиф, с древа снем пречистое Тело Твое, плащаницею чистою обвив, и вонями, во гробе нове покрыв положи».
На наружных стенах храма находятся изображения святых: над входом -Святая Равноапостольная Мария Магдалина, защитница и покровительница храма, ниже — Святая Равноапостольная Великая Княгиня Ольга. На левой стене (по часовой стрелке) — Святая Великомученица Александра (защитница и покровительница последней русской императрицы), Святой Захария (на лбу у него повязка с надписью «Святи Господа») и Святая Елисавета, — родители Иоанна Крестителя. В верхней части апсиды изображена икона Божией Матери — Одигитрия (Курская икона Божией Матери Путеводительница (Одигитрия) является иконой русской Православной Церкви Заграницей); ниже, среди пилястров, изображен Господь с Евангелием на Престоле (надпись: «Аз есмь свет миру»). В верхней части колокольни изображен Святой Александр Невский (надпись: «Благоверный великий князь»), а внизу над боковым входом — преподобный Сергий Радонежский, просветитель Земли Русской (надпись: «Любите друг друга»). Слева от колокольни мозаика, изображающая Святого Николая Чудотворца, защитника и покровителя Царя Николая II.